Batta Gyula munkacsoportja

Szerkezeti Biológiai és Molekuláris Felismerési Műhely (SZBM alapításának éve: 2010)

http://www.structbiol.unideb.hu/

 

Jelenlegi munkatársak:

Prof. Dr. Batta Gyula egyetemi tanár

Szervezeti egység Debreceni Egyetem, Természettudományi és Technológiai Kar, Kémiai Intézet, Szerves Kémiai Tanszék
Központi telefonszám +36 52 512 900 / 22234
E-mail
Cím 4032 Debrecen, Egyetem tér 1.
Épület, emelet, szobaszám Kémia épület, mélyföldszint, alsó földszint, E-18 (dolgozó szoba)
WeboldalTudóstér profil

Dr. Czajlik András tudományos munkatárs

Szervezeti egység Debreceni Egyetem, Természettudományi és Technológiai Kar, Kémiai Intézet, Szerves Kémiai Tanszék
Központi telefonszám +36 52 512 900 / 22590
Cím 4032 Debrecen, Egyetem tér 1.
Épület, emelet, szobaszám Kémia épület, alagsor, B13
Weboldal
 

Hallgatók:

Izsépi László, lev. PhD. hallgató (vegyész)

Erdei Réka Pálma, vegyész h. (MSc.)

File Márk, biomérnök h. (BSc.)

Pap Máté, biológus  h. (BSc.)

 

Kutatási témák:

  1. Fonalas gombákból származó, antimikrobiális hatású, kis diszulfid fehérjék térszerkezete, dinamikája, letekeredése és stabilitása, hatásmechanizmusuk molekuláris értelmezése.

 

  1. Antimikrobiális hatású glikopeptid antibiotikumok és származékaik hatás-szerkezet összefüggései

 

Reprezentatív közlemények:

1. Alex, Jimi M. ; Rennie, Martin L. ; Engilberge, Sylvain ; Lehoczki, Gábor ; Hajdu, Dorottya Zsuzsanna ; Fizil, Ádám ; Batta, Gyula ; Crowley, Peter B.
Calixarene-mediated assembly of a small antifungal protein
IUCRJ 6 : 2 pp. 1-10. , 10 p. (2019)

2.  Hajdu, Dorottya Zsuzsanna ; Huber, Anna ; Czajlik, András ; Tóth, Liliána ; Kele, Zoltán ; Kocsubé, Sándor ; Fizil, Ádám ; Marx, Florentine ; Galgóczy, László ; Batta, Gyula
Solution structure and novel insights into phylogeny and mode of action of the Neosartorya (Aspergillus) fischeri antifungal protein (NFAP)
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 129 pp. 511-522. , 12 p. (2019)

3. Tevyashova, Anna N. ; Bychkova, Elena N. ; Korolev, Alexander M. ; Isakova, Elena B. ; Mirchink, Elena P. ; Osterman, Ilya A. ; Erdei, Réka ; Szücs, Zsolt ; Batta, Gyula
Synthesis and evaluation of biological activity for dual-acting antibiotics on the basis of azithromycin and glycopeptides
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 29 : 2 pp. 276-280. , 5 p. (2019)

 

4. Batta, Gyula ; Bodor, Andrea ; Kövér, Katalin ; Martinek, Tamás ; Perczel, András ; Tőke, Orsolya
NMR- és ESR-spektroszkópia
In: Buday, L; Nyitray, L; Perczel, A (szerk.) Ezerarcú fehérjék
Budapest, Magyarország : Semmelweis Kiadó és Multimédia Stúdió, (2018) pp. 203-256. , 54 p.5.

 

5. Váradi, Györgyi ; Tóth, Gábor ; Batta, Gyula
Structure and Synthesis of Antifungal Disulfide β-Strand Proteins from Filamentous Fungi
Microorganisms 7 : 1 Paper: 5 , 10 p. (2019)
 

6.  Anna Huber, Dorottya Hajdu, Doris Bratschun-Khan, Zoltán Gáspári, Mihayl Varbanov, Stéphanie Philippot, Ádám Fizil, András Czajlik, Zoltán Kele, Christoph Sonderegger, László Galgóczy, Andrea Bodor, Florentine Marx, Gyula Batta

New antimicrobial potential and structural properties of PAFB: a cationic, cysteine-rich protein from Penicillium chrysogenum Q176

SCIENTIFIC REPORTS 8: Paper 1751. 16 p. (2018)

https://www.nature.com/articles/s41598-018-20002-2

 

7. Sándor Boros, Zoltán Gáspári, Gyula Batta

Accurate NMR determinations of proton–proton distances

ANNUAL REPORTS ON NMR SPECTROSCOPY 94: pp. 1-39. (2018)

 

8.  Tóth L, Váradi G, Borics A, Batta G, Kele Z, Vendrinszky Á, Tóth R, Ficze H, Tóth GK, Vágvölgyi C, Marx F, Galgóczy L

Anti-candidal activity and functional mapping of recombinant and synthetic Neosartorya fischeri antifungal protein 2 (NFAP2)

FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 9: Paper 393. 12 p. (2018) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5845869/

9.  Christoph Sonderegger, Ádám Fizil, Laura Burtscher, Dorottya Hajdu, Alberto Munoz, Zoltán Gáspári, Nick D. Read, Gyula Batta, and Florentine Marx

D19S Mutation of the Cationic, Cysteine-rich Protein PAF: Novel Insights into its Structural Dynamics, Thermal Unfolding and Antifungal Function.      PLoS ONE 12(1): e0169920. doi:10.1371/journal.pone.0169920 http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0169920

 

11.   Sonderegger C, Galgóczy L, Garrigues S, Fizil Á, Borics A, Manzanares P, Hegedüs N, Huber A, Marcos JF, Batta G, Marx F.

A Penicillium chrysogenum-based expression system for the production of small, cysteine-rich antifungal proteins for structural and functional analyses.

Microb Cell Fact. 2016 Nov 11;15(1):192.   PMID: 27835989   Free PMC Article

12. Boros S, Batta G.

Offset-compensated and zero-quantum suppressed ROESY provides accurate 1 H-1H distances in small to medium-sized molecules.

Magn Reson Chem. 2016 Dec;54(12):947-952. doi: 10.1002/mrc.4474.

 

13. Fizil Á, Gáspári Z, Barna T, Marx F, Batta G

"Invisible" Conformers of an Antifungal Disulfide Protein Revealed by Constrained Cold and Heat Unfolding, CEST-NMR Experiments, and Molecular Dynamics Calculations.

CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL 21:(13) pp. 5136-5144. (2015)

 

14.   Ilona Bereczki, Attila Mándi, Erzsébet Rőth, Anikó Borbás, Ádám Fizil, István Komáromi, Attila Sipos, Tibor Kurtán, Gyula Batta, Eszter Ostorházi, Ferenc Rozgonyi, Evelien Vanderlinden, Lieve Naesens, Ferenc Sztaricskai, Pál Herczegh

A few atoms make the difference: Synthetic, CD, NMR and computational studies on antiviral and antibacterial activities of glycopeptide antibiotic aglycon derivatives

EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY 94: pp. 73-86. (2015)

15.

Gyula Batta, Teréz Barna, Zoltán Gáspári, Szabolcs Sándor, Katalin E. Kövér, Ulrike Binder,Bettina Sarg, Lydia Kaiserer, Anil K. Chhillar, Andrea Eigentler, Éva Leiter, Nikoletta Hegedüs, István Pócsi, Herbert Lindner and Florentine Marx

Functional aspects of the solution structure and dynamics of PAF – a highly-stable antifungal protein from Penicillium chrysogenum

FEBS JOURNAL  276: pp. 2875-2890  (2009)  DOI: 10.1111/j.1742-4658.2009.07011.x

 

Összefoglaló:

  1. A fenyegető járványok, az antimikrobiális szerek elleni rezisztencia terjedése, a kultúrnövényekben okozott károk és a művészeti örökség védelme sürgetően igényli új antimikrobiális hatóanyagok felderítését. E célra alkalmasak lehetnek az amfipatikus jellegű, diszulfid minifehérjék. Rendkívül stabilak, töltésük segíti a célpont sejtmembránjának megtámadását, víztaszító részük pedig a kompakt fehérjeszerkezet kialakulását, amit diszulfid hidak stabilizálnak. Az általunk tanulmányozott kationos, ciszteinben gazdag, antifungális fehérjék néhány képviselőjéről kiderült hogy nem csak fonalas gombák, hanem Candida élesztő gomba (NFAP2) illetve humán koronavírus ellen (PAFB, PAF) is hatásosak. A vizsgált új, diszulfid minifehérjék PAFC, NFBP és NFAP2 filogenetikailag és néhány fizikai jellemző szerint is (össztöltés) elkülönülnek a PAF csoporttól. Munkánk során együttműködünk az Innsbruck-i Orvosegyetemmel,  a Szegedi Egyetemmel és a Pázmány Péter Katolikus Egyetemmel. Terveink a következők:
  1. Az új fehérjék és variánsaik előállítása heterológ expresszióval (15N/13C izotóp jelölés) és/vagy kémiai szintézissel, majd szerkezeti és dinamikai jellemzésük atomi felbontásban.
  2. A PAF-csoport (PAF, AFP, PAFB, NFAP) már ismert fehérjéinek részletes vizsgálatainak folytatása: kémiai denaturáció és hőmérséklet stressz által okozott letekeredés, diszulfid-híd konformáció és átkapcsolás, só- és H-hidak szerepe a hatásmechanizmusban.
  3. Új screening módszereket alkalmazunk a minifehérjék molekuláris célpontjainak azonosítására. A molekuláris hatásmechanizmusok kísérletes felderítéséhez 700 MHz-es NMR-t, tömegspektrometriát, ECD spektroszkópiát, ITC/DSC mikrokalorimetriát, és molekula dinamikai számításokat használunk.

 

  1. A kutatócsoport klasszikus témája a glikopeptid (vankomicin) típusú antibiotikumok és szintetikus változataik szerkezetvizsgálata NMR módszerekkel (együttműködés a DE Gyógyszerészi Kémiai Tanszékkel és a moszkvai Új Antibiotikumokat Kutató Gause Intézettel). Az új hatóanyagok között vizsgáljuk az eremomicinnel rokon vegyületeket, pl. a rezisztens Gram-pozitív baktérium törzsek ellen hatásos oritavancint. In-vitro körülmények közt tanulmányozzuk a hatóanyagok oligomerizációját vizes közegben illetve interakcióikat a peptidoglikán sejtfalát alkotó peptidekkel.

 

A pdb adatbázisba (https://www.rcsb.org/)  feltöltött fehérje szerkezeteink:

 
PAF (2mhv, 6ha4) sfPAFB (2nc2) NFAP (5oqs) BS-RNase (2lfj)  

 

 

 

 

Frissítés dátuma: 2020.01.09.


Tisztelt Felhasználó!

 

A Debreceni Egyetem kiemelt fontosságúnak tartja a rendelkezésére bocsátott, illetve birtokába jutott személyes adatok védelmét. Ezúton tájékoztatjuk Önt, hogy a Debreceni Egyetem a 2018. május 25. napjától kötelezően alkalmazandó Általános Adatvédelmi Rendelet alapján felülvizsgálta folyamatait és beépítette a GDPR előírásait az adatkezelési és adatvédelmi tevékenységébe. A felhasználók személyes adatait a Debreceni Egyetem korábban is teljes körültekintéssel kezelte, megfelelve az érvényben lévő adatkezelési szabályozásoknak. A GDPR előírásait követve frissítettük Adatvédelmi Tájékoztatónkat, amelyet az alábbi linkre kattintva olvashat el: Adatkezelési tájékoztató. DE Kancellária VIR Központ

A tájékoztatót megismertem.