Szénhidrát-fehérje kölcsönhatások

Glikán-fehérje kölcsönhatások vizsgálata 77Se-alapú NMR módszerekkel

Sejtfelszíni glikánok fehérjékkel való kölcsönhatásának jellemzésére új, hatékony NMR spektroszkópiai módszereket dolgozunk ki. A kifejlesztett 1H-77Se CPMG-HSQMBC kísérlet kiváló érzékenységű a protongerjesztésnek és -detektálásnak, illetve a CPMG-típusú polarizációtranszfernek köszönhetően, továbbá kétdimenziós voltából fakadóan kiemelkedő spektrális felbontást szolgáltat. A módszerrel szelenodigalaktozidok kötődését vizsgáltuk különböző humán lektinekhez (Gal-1, 3, 7) és egy növényi toxinhoz (VAA). Az általunk kidolgozott NMR impulzusszekvencia érzékenyen és szelektíven jelzi a ligandumok fehérjéhez kötődését több, versengő ligandum egyidejű jelenléte esetén is, illetve lehetőséget nyújt a ligandumok kötéserősség szerinti sorba rendezésére is.

 

M. Raics, I. Timári, T. Diercks, L. Szilágyi, H.-J. Gabius, K. E. Kövér:
Selenoglycosides as Lectin Ligands: 77Se‐Edited CPMG‐HSQMBC NMR Spectroscopy To Monitor Biomedically Relevant Interactions
ChemBioChem 2019, 20, 1688.

 

 

 

 

Heparin-analóg pentaszacharidok kölcsönhatása antitrombin-III fehérjével

 

Ezen kutatás középpontjában a pentaszacharid-triszulfonsav származék áll, melynek az idraparinux és a pentaszacharid-diszulfonsav származékhoz képest jelentősen csökkent biológiai aktivitásának okára kívánunk magyarázatot adni. A kötődés mechanizmusának minél részletesebb felderítésének érdekében molekuldinamikai szimulációkat tervezünk elvégezni, melyhez elengedhetetlen a lehető legalkalmasabb erőtér kiválasztása illetve az alkalmazott erőtér paramétereinek fejlesztése.

 

 

Frissítés dátuma: 2019.11.11.


Tisztelt Felhasználó!

 

A Debreceni Egyetem kiemelt fontosságúnak tartja a rendelkezésére bocsátott, illetve birtokába jutott személyes adatok védelmét. Ezúton tájékoztatjuk Önt, hogy a Debreceni Egyetem a 2018. május 25. napjától kötelezően alkalmazandó Általános Adatvédelmi Rendelet alapján felülvizsgálta folyamatait és beépítette a GDPR előírásait az adatkezelési és adatvédelmi tevékenységébe. A felhasználók személyes adatait a Debreceni Egyetem korábban is teljes körültekintéssel kezelte, megfelelve az érvényben lévő adatkezelési szabályozásoknak. A GDPR előírásait követve frissítettük Adatvédelmi Tájékoztatónkat, amelyet az alábbi linkre kattintva olvashat el: Adatkezelési tájékoztató. DE Kancellária VIR Központ

A tájékoztatót megismertem.