Glikán-fehérje kölcsönhatások vizsgálata 77Se-alapú NMR módszerekkel
Sejtfelszíni glikánok fehérjékkel való kölcsönhatásának jellemzésére új, hatékony NMR spektroszkópiai módszereket dolgozunk ki. A kifejlesztett 1H-77Se CPMG-HSQMBC kísérlet kiváló érzékenységű a protongerjesztésnek és -detektálásnak, illetve a CPMG-típusú polarizációtranszfernek köszönhetően, továbbá kétdimenziós voltából fakadóan kiemelkedő spektrális felbontást szolgáltat. A módszerrel szelenodigalaktozidok kötődését vizsgáltuk különböző humán lektinekhez (Gal-1, 3, 7) és egy növényi toxinhoz (VAA). Az általunk kidolgozott NMR impulzusszekvencia érzékenyen és szelektíven jelzi a ligandumok fehérjéhez kötődését több, versengő ligandum egyidejű jelenléte esetén is, illetve lehetőséget nyújt a ligandumok kötéserősség szerinti sorba rendezésére is.
M. Raics, I. Timári, T. Diercks, L. Szilágyi, H.-J. Gabius, K. E. Kövér:
Selenoglycosides as Lectin Ligands: 77Se‐Edited CPMG‐HSQMBC NMR Spectroscopy To Monitor Biomedically Relevant Interactions
ChemBioChem 2019, 20, 1688.
Heparin-analóg pentaszacharidok kölcsönhatása antitrombin-III fehérjével
Ezen kutatás középpontjában a pentaszacharid-triszulfonsav származék áll, melynek az idraparinux és a pentaszacharid-diszulfonsav származékhoz képest jelentősen csökkent biológiai aktivitásának okára kívánunk magyarázatot adni. A kötődés mechanizmusának minél részletesebb felderítésének érdekében molekuldinamikai szimulációkat tervezünk elvégezni, melyhez elengedhetetlen a lehető legalkalmasabb erőtér kiválasztása illetve az alkalmazott erőtér paramétereinek fejlesztése.